Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms