Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPLO60437 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PPLO60437 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPLO60437 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPLO60437 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPLO60437 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms