Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms