Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms