Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB3O43889 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB3O43889 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB3O43889 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB3O43889 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms