Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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