Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VILLO15195 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
VILLO15195 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VILLO15195 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VILLO15195 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VILLO15195 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VILLO15195 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms