Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms