Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PIK3C2BO00750 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2BO00750 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms