Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA2O00451 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms