Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA8SH3BPF8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms