Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POTEMA6NI47 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POTEMA6NI47 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms