Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms