Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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