Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CPQQ9Y646 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPQQ9Y646 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPQQ9Y646 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPQQ9Y646 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms