Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIKFYVEQ9Y2I7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIKFYVEQ9Y2I7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms