Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCG2Q9UNQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG2Q9UNQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCG2Q9UNQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG2Q9UNQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG2Q9UNQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCG2Q9UNQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG2Q9UNQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCG2Q9UNQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms