Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN2Q9UNF0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PACSIN2Q9UNF0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACSIN2Q9UNF0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN2Q9UNF0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms