Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLXNB3Q9ULL4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNB3Q9ULL4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNB3Q9ULL4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNB3Q9ULL4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNB3Q9ULL4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNB3Q9ULL4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNB3Q9ULL4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNB3Q9ULL4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNB3Q9ULL4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNB3Q9ULL4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNB3Q9ULL4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms