Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKLN1Q9UL63 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKLN1Q9UL63 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms