Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXL4Q9UKA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXL4Q9UKA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXL4Q9UKA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms