Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

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Length 692 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF180Q9UJW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF180Q9UJW8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF180Q9UJW8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF180Q9UJW8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF180Q9UJW8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF180Q9UJW8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF180Q9UJW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF180Q9UJW8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF180Q9UJW8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF180Q9UJW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF180Q9UJW8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF180Q9UJW8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF180Q9UJW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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