Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMPXQ9UHP9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms