Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL3Q9UH77 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL3Q9UH77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL3Q9UH77 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms