Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF1Q9UH73 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF1Q9UH73 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms