Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPC4Q9UBN4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC4Q9UBN4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC4Q9UBN4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms