Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAE1Q9UBE0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SAE1Q9UBE0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAE1Q9UBE0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms