Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CGNQ9P2M7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNQ9P2M7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CGNQ9P2M7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNQ9P2M7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms