Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms