Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP36Q9P275 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP36Q9P275 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP36Q9P275 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms