Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAPAQ9P0L0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAPAQ9P0L0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAPAQ9P0L0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms