Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCMF1Q9P0J7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms