Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA13Q9P0J0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFA13Q9P0J0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFA13Q9P0J0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFA13Q9P0J0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms