Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED11Q9P086 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED11Q9P086 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms