Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF4Q9P032 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF4Q9P032 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF4Q9P032 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms