Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH4Q9P003 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH4Q9P003 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms