Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBP1Q9NZI7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBP1Q9NZI7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBP1Q9NZI7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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