Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN3Q9NZ94 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN3Q9NZ94 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLGN3Q9NZ94 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms