Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GIN1Q9NXP7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms