Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CHCHD3Q9NX63 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD3Q9NX63 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms