Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COMMD8Q9NX08 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COMMD8Q9NX08 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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