Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD2Q9NV79 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCMTD2Q9NV79 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms