Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC3Q9NUV7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC3Q9NUV7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms