Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2CQ9NQX7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITM2CQ9NQX7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITM2CQ9NQX7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms