Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREM1Q9NP99 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TREM1Q9NP99 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms