Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMG20AQ9NP66 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms