Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PREBQ9HCU5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PREBQ9HCU5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms