Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC07

TMEM165, Transmembrane protein 165, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM165Q9HC07 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM165Q9HC07 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM165Q9HC07 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM165Q9HC07 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM165Q9HC07 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM165Q9HC07 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM165Q9HC07 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM165Q9HC07 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM165Q9HC07 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms