Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM27Q9HBJ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms