Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C11orf49Q9H6J7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C11orf49Q9H6J7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C11orf49Q9H6J7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C11orf49Q9H6J7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C11orf49Q9H6J7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C11orf49Q9H6J7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
C11orf49Q9H6J7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms